Zwiedzanie Fabryki rozpoczyna się od spotkania z przewodnikiem przed główną bramą Muzeum. Przewodnik zabierze Cię bez kolejki do miejsca, w którym rozpoczyna się wystawa „Kraków pod okupacją hitlerowską”, znajdująca się na 3 poziomach fabryki. Wystawa jest ułożona chronologicznie i rozpoczyna się od prezentacji życia w Krakowie przed wybuchem II wojny światowej. Następnie przewodnik po różnych salach wystawowych opowie, jak narastał terror wojenny i jak na sytuację poszczególnych osób wpłynęła obecność hitlerowców w Krakowie.

Podczas trasy zobaczysz na przykład oryginalną broń z wojny w postaci małego niemieckiego czołgu Goliata i broni używanej przez członków ruchu oporu. Odwiedzisz replikę prawdziwego mieszkania w krakowskim getcie i odkryjesz luksusy i przywileje nazistowskiego życia w okupowanym mieście. Przewodnik pokaże Ci miejsca, w których nakręcono film „Lista Schindlera” i opowie prawdziwe i kontrowersyjne historie z życia Oscara Schindlera. Punktem kulminacyjnym wycieczki będzie wizyta w nowo otwartym nazistowskim obozie pracy.

Wycieczka kończy się symbolicznym oknem, w którym przewodnik pokaże ludziom z listy Schindlera i opowie o ich dalszych losach. Oprowadzanie Fabryki Schindlera to najlepsze miejsce, aby nie tylko w pełni poznać, ale także zrozumieć, co wydarzyło się w Krakowie ponad 80 lat temu.